La investigación clínica en el hospital se desarrolla junto al Instituto de Investigación Biomédica de Sevilla y el apoyo de la fundación FISEVI
Se divide en distintas unidades según su área de actuación
Unidad fase I- II; ensayos clínicos en fases iniciales de desarrollo (UEFI/II)
Unidad de apoyo metodológico y estadístico (UAME)